鴨嘴獸是為數(shù)不多的基因組已經(jīng)被測(cè)序的復(fù)雜生物之一。
本報(bào)訊 11月1日，一項(xiàng)對(duì)全球所有復(fù)雜生物體基因組進(jìn)行測(cè)序的雄心勃勃的計(jì)劃在英國(guó)倫敦正式啟動(dòng)。
“基因變異是所有遺傳學(xué)知識(shí)的源泉。”項(xiàng)目成員之一、澳大利亞墨爾本拉籌伯大學(xué)進(jìn)化遺傳學(xué)家Jenny Graves說，“你擁有的基因變異越多就越好——那么為什么不對(duì)所有的事物展開測(cè)序呢？”
這項(xiàng)地球生物基因組計(jì)劃的目標(biāo)便是在未來10年內(nèi)對(duì)全世界約150萬(wàn)種已知的動(dòng)物、植物、原生動(dòng)物和真菌物種(統(tǒng)稱為真核生物)的基因組進(jìn)行測(cè)序。這項(xiàng)倡議估計(jì)耗資47億美元，到目前為止只籌劃到其中的一小部分資金。
作為這項(xiàng)計(jì)劃的一部分，來自茵格斯頓市惠康桑格研究所的科學(xué)家宣布，他們計(jì)劃在未來8年的時(shí)間里花費(fèi)5000萬(wàn)歐元(6500萬(wàn)美元)對(duì)英國(guó)的真核生物基因組進(jìn)行測(cè)序，其數(shù)量約為66000種。
對(duì)惠康桑格研究所的支持——將來自該所的總體預(yù)算——是迄今為止對(duì)這項(xiàng)努力最大的承諾之一。
據(jù)美國(guó)加利福尼亞大學(xué)戴維斯分校進(jìn)化生物學(xué)家、地球生物基因組計(jì)劃工作組主席Harris Lewin估計(jì)，關(guān)于該項(xiàng)目迄今為止所作的財(cái)政承諾總計(jì)約2億美元。這是該項(xiàng)目為期3年的“第一階段”的預(yù)估成本的1/3。這一階段打算對(duì)9000類已知的真核生物中的每一類的至少1個(gè)物種的基因組進(jìn)行測(cè)序。他希望在1年內(nèi)籌集到剩余的資金。
地球生物基因組計(jì)劃包括十多個(gè)現(xiàn)有的測(cè)序項(xiàng)目。例如生命之樹的特定分支，如鳥類、昆蟲和植物；或者對(duì)于一個(gè)特定國(guó)家的生物多樣性的研究，如在英國(guó)被正式稱為達(dá)爾文生命之樹的項(xiàng)目。
Lewin表示:“我們不需要一個(gè)基因組計(jì)劃來控制所有的項(xiàng)目。”相反，他說，這項(xiàng)努力存在的理由便是為了確保正在進(jìn)行的生物多樣性測(cè)序工作的標(biāo)準(zhǔn)化。
“當(dāng)你接近不同的科學(xué)團(tuán)體后，會(huì)發(fā)現(xiàn)那是處于混亂和無(wú)政府狀態(tài)的。”Lewin說，“如果到最后，每個(gè)人都在做自己的事情，那得到的就是巴別塔了。”
在此次倫敦召開的會(huì)議上，與會(huì)者討論了樣本采集、測(cè)序、數(shù)據(jù)管理和共享的指導(dǎo)方針。Lewin認(rèn)為，制定這樣的標(biāo)準(zhǔn)對(duì)于使基因組對(duì)所有的科學(xué)家都有用——而不僅僅是對(duì)某一特定領(lǐng)域的科學(xué)家有用，是至關(guān)重要的。
參與這項(xiàng)工作的科學(xué)家說，因?yàn)榈厍蛏锘蚪M計(jì)劃是一個(gè)傘形組織，它對(duì)于確保測(cè)序工作能夠覆蓋所有生命科學(xué)分支也很有價(jià)值，而不僅僅是那些之前吸引科學(xué)家關(guān)注的領(lǐng)域。
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