實驗室/課題組簡介
開展人工智能超級計算精準藥物發(fā)現(xiàn)研究,把最新的人工智能工具用于預測藥物-靶標相互作用,疫苗靶向設(shè)計以及藥物篩選(Nature MI),重定位和全新設(shè)計實踐之中。開發(fā)了AI藥物發(fā)現(xiàn)軟件SAMM,把深度學習等非線性方法開發(fā)了統(tǒng)計預測模型以及基于web的軟件工具并應用到藥物構(gòu)效關(guān)系,藥物代謝以及毒理和基因表型相關(guān)性的研究中,開發(fā)ADMET在線預測平臺,并將其應用到各種典型體系。通過超大規(guī)模的高性能計算和虛擬篩選,我們發(fā)現(xiàn)花椒有效成分WGX-50具有極強的抗炎癥和抗氧化作用,再抗衰老產(chǎn)品開發(fā)中得到了很好的應用。開展新冠的生物信息學研究,發(fā)現(xiàn)了幾個中藥有效成分具有抗新型冠狀病毒作用,篩選出了一個新冠病毒的有效多肽抑制劑——人腸防御素5。通過掩蔽受體,人血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2(ACE2)抑制新冠病毒突刺蛋白對人黏膜細胞的侵襲,從而阻斷新冠病毒傳染途徑,論文發(fā)表在Gastroenterology之上,它解釋了為何病毒不通過消化系統(tǒng)傳染。被“Faculty Opinions”選作推薦論文,并由德國基爾大學的免疫學專家Jens-Michael Schröder 教授進行點評,評論指出了該項工作給預防或治療新冠肺炎提供全新途徑—既可以使用HD5作為治療藥物,也可以通過刺激內(nèi)源性HD5的合成來預防或治療。為此,魏冬青被評為上海市微生物學會抗疫突出貢獻優(yōu)秀會員。
PI簡介
魏冬青,上海交通大學生命科學技術(shù)學院長聘教授,皇家化學學會會士,長期從事生物信息學、人工智能輔助藥物設(shè)計的研究工作,再交叉學科諸多領(lǐng)域做出了開拓性的工作,特別是首次從理論上證明了特別液晶的存在,首次揭示爆炸微觀反應機理以及發(fā)現(xiàn)并驗證了花椒素的抗衰老作用。在Gastroenterology、JACS、Physical Review Letters、Briefings in Bioinformatics、Journal of Chemical Theory and Computation等國際期刊發(fā)表了學術(shù)論文600多篇,主編專著12本,累計引用超1萬3千多次,H-index63;H10-index252。開發(fā)了多款數(shù)據(jù)庫、深度學習、分子模擬和藥物設(shè)計軟件,獲軟件著作權(quán)近20項;獲得上海市科技進步一等獎,中華醫(yī)學二等獎,中國計算機學會自然科學二等獎等;擔任Springer期刊“Interdisciplinary Sciences–Computational Life Sciences”(交叉科學–計算生命科學)主編、現(xiàn)代計算機輔助藥物設(shè)計(CCADD)主編,中國衛(wèi)生信息學會大數(shù)據(jù)應用評估與保障專業(yè)委員會副主委,生物工程學會生物信息專委會副主委。
應聘條件
2、近三年內(nèi)在國內(nèi)外獲得博士學位,年齡35周歲以下;生物信息學,計算生物學、計算機,數(shù)據(jù)科學等相關(guān)專業(yè);
3、具有Python,Perl或者R等編程基礎(chǔ),具備一定的數(shù)據(jù)建模及機器學習(深度學習)建模技能,有人工智能項目開發(fā)經(jīng)驗者優(yōu)先。
4、有志從事人工智能藥物開發(fā)研究;具備創(chuàng)新精神、獨立工作能力和團隊協(xié)作精神;具有良好的英文寫作與溝通能力;以第一作者的身份發(fā)表SCI研究論文至少1篇(其中一篇影響因子大于3.0)。
崗位職責
1、人工智能抗COVID-19藥物與疫苗設(shè)計
2、抗衰老實驗研究
3、深度學習在計算生物學中的應用
4、蛋白機器的計算機模擬
崗位待遇
1、年薪不低于24萬元(按上海交通大學博士后相關(guān)規(guī)定執(zhí)行);
2、實驗室提供良好的科研條件(計算資源)和充足穩(wěn)定的經(jīng)費支持,支持博士后在站期間申報各項研究項目,如“博士后創(chuàng)新人才支持計劃”、“上海市超級博士后計劃”、“國家自然科學基金青年項目”、“中國博士后科學基金”等,獲資助者享受相關(guān)待遇(薪酬大幅度提升);
3、按照上海市和上海交通大學博士后相關(guān)政策享受待遇(落戶、博士后公寓、五險一金等,詳見網(wǎng)站https://postd.sjtu.edu.cn/)。
4、博士后首聘期為2年。上海交通大學為優(yōu)秀博士后提供專有晉升通道。條件優(yōu)秀者出站后可直接申請上海交通大學長聘教軌與研究系列教師。
聯(lián)系方式
請申請者將個人簡歷、代表性論文全文、博士論文中文摘要、研究工作經(jīng)歷和至少兩位推薦人的姓名,并簡要說明申請理由,將聯(lián)系方式發(fā)送至dqwei@sjtu.edu.cn(郵件標題注明:應聘某某崗位+本人姓名 )。
聯(lián)系人:魏冬青教授
聯(lián)系地址:上海市閔行區(qū)東川路800號上海交通大學生命科學技術(shù)學院
網(wǎng)址:http://tacc2008.sjtu.edu.cn/
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為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至:boshijob@126.com(郵件標題格式:應聘職位名稱+姓名+學歷+專業(yè)+中國博士人才網(wǎng))
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