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復(fù)旦大學(xué)復(fù)雜體系多尺度研究院2024年招聘公告

時間:2023-12-27來源:中國博士人才網(wǎng) 作者:佚名

成立于2018年10月的“復(fù)雜體系多尺度研究院(MRICS)”坐落于復(fù)旦大學(xué)張江校區(qū),由上海市“高峰人才計(jì)劃”支持。MRICS致力于發(fā)展全新而有效的、貫通微觀分子結(jié)構(gòu)直至宏觀醫(yī)學(xué)成像的多尺度影像分析技術(shù),為解析生命奧秘提供前所未有的、囊括分子-細(xì)胞-組織-器官乃至整個生物體的時空影像數(shù)據(jù)。目前MRICS已經(jīng)建成一個最先進(jìn)的冷凍電鏡平臺,其中包括FEI Titan Krios,Glacios,Talos和Aquilos等。整套設(shè)施于2020年1月1號投入使用。我們的團(tuán)隊(duì)包括諾貝爾獎得主Michael Levitt教授和國際一流交叉學(xué)科專家等。

目前,研究院已擁有國際一流的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測算法開發(fā)平臺和世界領(lǐng)先的冷凍電鏡平臺,不斷發(fā)展全新而有效的、貫通微觀分子結(jié)構(gòu)直至宏觀醫(yī)學(xué)成像的多尺度影像分析技術(shù),為解析生命奧秘提供前所未有的,囊括分子、細(xì)胞、組織、器官乃至整個生物體的時空影像數(shù)據(jù)。成立至今,研究院已建設(shè)起具備干濕結(jié)合、基于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的全鏈條AI賦能新藥創(chuàng)新的一體化研發(fā)平臺。

全球領(lǐng)先計(jì)算生物學(xué)AI算法開發(fā)平臺

研究院科研團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)的蛋白質(zhì)折疊算法和側(cè)鏈建模算法,精度顯著優(yōu)于AlphaFold2,側(cè)鏈更接近天然構(gòu)象;在蛋白質(zhì)突變領(lǐng)域,原創(chuàng)算法可以對點(diǎn)突變可能帶來的生物學(xué)功能變化進(jìn)行準(zhǔn)確預(yù)測。團(tuán)隊(duì)原創(chuàng)的冷凍電鏡解析算法成功補(bǔ)充了冷凍電子顯微鏡(Cryo-EM)結(jié)構(gòu)解析技術(shù)中因傳統(tǒng)方法無法分辨而缺損的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),并高效且精準(zhǔn)地分辨出柔性極大的結(jié)構(gòu)區(qū)在蛋白受測樣品中的構(gòu)象分布。原創(chuàng)的分子動力學(xué)模擬增強(qiáng)取樣算法對AlphaFold2預(yù)測結(jié)構(gòu)中的誤差予以修正,在精度上超越專用計(jì)算機(jī)Anton,達(dá)到全球最優(yōu)。

研究院與上海人工智能實(shí)驗(yàn)室共同組建計(jì)算生物學(xué)創(chuàng)新中心,以人工智能為技術(shù)中樞,構(gòu)建新一代生物體系分析工具與方法,解讀生物遺傳信息,加速生命科學(xué)在分子層面的研究。通過對蛋白質(zhì)、DNA等分子功能結(jié)構(gòu)的預(yù)測與設(shè)計(jì),打破生物數(shù)據(jù)壁壘,為生命科學(xué)研究提供新的思路與方法。

生物信息學(xué)單細(xì)胞測序分析平臺

研究院自主開發(fā)了完整的生物信息學(xué)研究平臺。特別是單細(xì)胞大數(shù)據(jù)平臺,團(tuán)隊(duì)基于此不斷挖掘細(xì)胞類型和細(xì)胞亞群之間的差異,深入探索單細(xì)胞水平的基因表達(dá)差異并揭示其內(nèi)部復(fù)雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),以解析細(xì)胞分化、發(fā)育和疾病機(jī)制。同時,團(tuán)隊(duì)致力于整合來自基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等多個組學(xué)的數(shù)據(jù),建立跨層次關(guān)聯(lián)探尋生物學(xué)含義,并結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)算法,挖掘潛在的基因和蛋白質(zhì)靶標(biāo),為疾病診斷和創(chuàng)新藥物開發(fā)提供新的思路和方向。該領(lǐng)域技術(shù)對研究疾病中的細(xì)胞命運(yùn)決定和分子學(xué)基礎(chǔ)至關(guān)重要。

結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究平臺

冷凍電子顯微技術(shù)作為結(jié)構(gòu)生物學(xué)最重要的研究手段之一,在研究蛋白質(zhì)、細(xì)胞和組織的結(jié)構(gòu)和功能中起到至關(guān)重要的作用。目前研究院建有各類冷凍電子透射顯微鏡(包括FEI Titan Krios,Glacios,Talos和Aquilos等),以及高性能的計(jì)算集群,可以從高分辨率的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)(分子生物學(xué))和原位環(huán)境下蛋白、細(xì)胞組織的空間分布(細(xì)胞生物學(xué))等不同尺度來回答前沿的生命科學(xué)問題,研究對象包括蛋白質(zhì)生物大分子、亞細(xì)胞器乃至細(xì)胞和組織,研究方法包括冷凍電鏡單顆粒技術(shù)、原位電子斷層掃描技術(shù)和原位單顆粒技術(shù)等。

研究院打造了一支跨學(xué)科的國際化研究團(tuán)隊(duì),其中包括國際頂尖的計(jì)算結(jié)構(gòu)生物學(xué)專家、2013年諾貝爾化學(xué)獎得主Michael Levitt教授,2004年Norman Hackermann化學(xué)研究獎獲得者馬劍鵬教授以及來自美國斯坦福大學(xué)、貝勒醫(yī)學(xué)院、萊斯大學(xué)、加州大學(xué)伯克利分校、清華大學(xué)、中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)、中國科學(xué)院大學(xué)等高層次人才及青年研究員。自2018年以來,研究院科研團(tuán)隊(duì)的重要成果相繼發(fā)表在Nature, Science, PNAS, Nucleic Acids Research, Cell Reports等頂級科學(xué)雜志。

招聘方向:

一、計(jì)算生物學(xué)相關(guān)研究崗(碩士和博士)

具體招聘崗位:多級別崗位包括青年研究員、專任工程師、博士后、科研助理等虛位以待。

招收方向:

1、人工智能基礎(chǔ)理論研究,包括但不限于機(jī)器學(xué)習(xí)、強(qiáng)化學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)等。

2、人工智能基礎(chǔ)軟件研發(fā),包括但不限于新一代人工智能訓(xùn)練框架等。

3、人工智能算法與統(tǒng)計(jì)力學(xué)及量子力學(xué)相結(jié)合的理論創(chuàng)新研究。

4、人工智能算法在計(jì)算生物物理學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用,尤其是三維蛋白質(zhì)及核酸結(jié)構(gòu)預(yù)測,冷凍電鏡數(shù)據(jù)處理,高性能蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)動力學(xué)模擬,藥物分子的虛擬篩選等領(lǐng)域。

5、人工智能輔助生物信息學(xué),尤其是在分析生物大數(shù)據(jù)方向的應(yīng)用,比如整合臨床大數(shù)據(jù)、組學(xué)數(shù)據(jù)、基因組數(shù)據(jù)、單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)等并挖掘新型藥物作用靶標(biāo)等。

任職要求:在國內(nèi)外知名高校獲得應(yīng)用數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、計(jì)算物理學(xué)、計(jì)算生物學(xué)、計(jì)算化學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)及人工智能算法等相關(guān)領(lǐng)域,具有碩士/博士學(xué)位,或具有博后經(jīng)歷,在本領(lǐng)域具有代表性研究成果,有志于人工智能及計(jì)算生物學(xué)前沿研究,并具有良好的團(tuán)隊(duì)協(xié)作精神。

本院優(yōu)勢:

1.依據(jù)科研任務(wù)和學(xué)術(shù)目標(biāo),提供充足的經(jīng)費(fèi)支撐,可持續(xù)追加經(jīng)費(fèi)支持;并提供具有國際競爭力的薪酬,可對標(biāo)國內(nèi)任何單位能提供的薪酬標(biāo)準(zhǔn)。

2.支持全球招募優(yōu)秀研究和工程人員,給予高校博士研究生及博士后培養(yǎng)名額;可支持申報國家"博新計(jì)劃"、國際交流計(jì)劃引進(jìn)項(xiàng)目、博士后科學(xué)基金特別資助、或上海市超級博士后計(jì)劃等。

二、生物學(xué)相關(guān)研究崗(碩士和博士)

任職要求:

在國內(nèi)外高校獲得基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、腫瘤生物學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域碩士/博士學(xué)位,或具有博后經(jīng)歷,在本領(lǐng)域具有代表性研究成果,并具有良好的團(tuán)隊(duì)協(xié)作精神;

招收方向:

1.掌握流式細(xì)胞術(shù)、蛋白純化、細(xì)胞培養(yǎng)、PCR、RT-PCR等細(xì)胞分子生物學(xué)相關(guān)知識和經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先;

2.掌握CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)和經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先;

3.精通動物實(shí)驗(yàn)的操作技術(shù)和經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先;

4.熟練藥物合成相關(guān)知識和經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先。

本院優(yōu)勢:

1.依據(jù)科研任務(wù)和學(xué)術(shù)目標(biāo),提供充足的經(jīng)費(fèi)支撐,可持續(xù)追加經(jīng)費(fèi)支持;

2.提供具有國際競爭力的薪酬,可對標(biāo)國內(nèi)任何單位能提供的薪酬標(biāo)準(zhǔn);

3.與上海人工智能實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合招募,集聚全球優(yōu)秀人工智能及計(jì)算生物學(xué)科研人才。

三、福利待遇:

一人一議,具體多少需要面試溝通(碩士年薪20-40萬,博士年薪30-80萬)。

提供食堂、宿舍,五險一金繳納的基數(shù)、比例:按事業(yè)單位最高比例交

工作地址:上海浦東新區(qū)張衡路825號

四、投遞方式:

聯(lián)系人:楊老師  13503077519(微信同號)

 郵箱投遞:fddxfztxdcdyjy@163.com,郵件標(biāo)題注明:應(yīng)聘某某崗位+本人姓名 。

為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至:boshijob@126.com(郵件標(biāo)題格式:應(yīng)聘職位名稱+姓名+學(xué)歷+專業(yè)+中國博士人才網(wǎng))

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