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越是重大意外發(fā)現(xiàn) 越需要多層次重復

時間:2022-06-28來源:中國科學報 作者:佚名

■本報記者 陳歡歡

《自然》曾對1576名研究人員進行過一次在線問卷調查。結果顯示,超過70%的科學家在嘗試重復別人的實驗時失敗,一半以上甚至無法還原自己的實驗。

實驗重復到底有多重要?為什么實驗結果會重復不了?在進行重復實驗時要注意什么?中國科學院院士、分子微生物學家趙國屏在接受《中國科學報》采訪時表示,越是“重大意外”發(fā)現(xiàn),越需要“多層次重復”。他結合自身經驗,提出許多實操建議。

《中國科學報》:在您所從事的生物學研究中,重復實驗對確保結果正確性有多重要?

趙國屏:可重復的重要性是毋庸置疑的。實驗科學區(qū)別于其他科學研究的核心,就是在可以控制的條件下,以可以重復的實驗方法,去發(fā)現(xiàn)或認識物質運動的規(guī)律。這里有兩個關鍵詞,一是“條件可控”,二是“可以重復”。

我在大學學電鏡的時候,老師給我們看過一張圖,可能很多人都看過——《美女還是巫婆》。這張圖從不同視角看結論是不一樣的。因此,老師說,“看電鏡照片,你想看到什么就會看到什么;沒有其他相應的證據,僅憑‘看到的結果’不能說明問題。”這也是我們開展實驗科學的意義所在,通過多視角、多層次的重復,驗證實驗所揭示“認知”的準確性、客觀性。

“條件可控”是“可以重復”的前提,在生命科學研究中有多種控制條件的方法。一是隔離,就是把“體內”復雜系統(tǒng)中的某些問題放到細胞、亞細胞或者分子層次上,進行“體外”實驗研究。二是設置對照,生命運動涉及因素繁多,且往往互相影響,可以使用“對照”的辦法控制條件。但每次只比對一個條件,而且盡可能控制其他條件不變,也不容易。三是正確的檢測方法,譬如,盡可能獲得定量數(shù)據,注意數(shù)據檢測的線性范圍,注意采集序貫而非簡單重復數(shù)據等。上述三個方面,都是為了在不同層次上保證實驗(數(shù)據)可以被重復。

《中國科學報》:雖然重復如此重要,但是《自然》曾做過一次問卷調查,結果顯示,超過70%的科學家無法重復別人的實驗,一半以上無法還原自己的實驗。您認為出現(xiàn)這兩種情況的原因是什么?對于重復不了的實驗,應該如何理性看待?

趙國屏:這兩種情況比較常見,并不奇怪,但是原因很復雜,可能有多個不同層次的答案。

需要強調,這種討論必須首先排除主觀的“學術不端”。數(shù)據造假或者“刻意”修改數(shù)據的“實驗結果”自然無法重復。造假是嚴重的學術不端行為,是絕對不能容忍的,一造假就斷送了一生的學術生涯。所以,判定造假需要充分的證據,包括認定“造假動機”。

不可重復并不意味著一定造假了,也可能是認識不足、方法局限、操作不當?shù)人鶎е碌模31憩F(xiàn)為“不可完全重復”。在生命科學研究中,最常見的原因往往與上述三個“控制條件”不完備有關。這方面我自己就有很多經驗教訓。

我的一位學生曾經在體外實驗中,“證實”了國外研究者提出的一個調控因子磷酸化的假說,并向期刊投稿。審稿人提出,相應的體內表型數(shù)據不充分。該學生因此開始懷疑自己以往的實驗結果,在重復實驗中發(fā)現(xiàn)過去結論是“假陽性”,換了一種方法后,結果正相反。最后,他又用了兩年時間,通過結構生物學、生化分子生物學(體外)以及遺傳與生理(體內)等實驗,綜合證明了“不能磷酸化”這個“真陰性”的結果,發(fā)表了很好的論文。

類似的例子很多。檢測方法、試劑和樣品的取樣及存儲條件等都會影響實驗結果的可重復性。有些生化試劑不穩(wěn)定,放置一段時間濃度會改變,如果不較準濃度,結果自然無法完全重復。

再如,實驗室測酶活的方法一般都是標準化的,但研究中往往使用突變的酶,活性不是高就是低,并不“標準”。如果不針對具體情況調整檢測方法,實驗結果也不能重復。

當然,即便“能重復”的實驗,也不見得都是正確的或者“真的”。我的實驗室曾經在某“結構域假說”的指引下,認為我們所研究的酶應該是四聚體,并得到了“分子篩”實驗測定的分子量證實。但十幾年過去,在AlphaFold2指導下,我們預測了三維結構,認識到這個酶應該是二聚體,并被近年發(fā)展起來的更精準的測定方法所證實,推翻了自己以前的結論,F(xiàn)在回頭看,當時只覺得結果“符合假說”就認可了,沒認識到這是由于低分辨率帶來的“假象”,F(xiàn)在我們正準備寫文章,不僅糾正過去的錯誤,更將為這一大類酶結構功能的關系提供全新的知識模型。

不管怎么說,科學研究是可能犯錯誤的。我們既要努力規(guī)避錯誤,也要在犯錯誤之后認真改正,提升研究水平。把心思放到探尋科學規(guī)律的本質上,才是應有的科學態(tài)度。

《中國科學報》:您的實驗室對重復實驗有何要求?能否給年輕科研人提供一些經驗指導?

趙國屏:我們實驗室有句老話:如果你有意外的重要發(fā)現(xiàn),第一件事情就是去重復。越是“重大意外”發(fā)現(xiàn),越不能頭腦發(fā)熱。

在生命科學研究實踐中,的確有一些重大突破來自于實驗或觀測的“意外”。但是,更多的意外是人為“錯誤”所致,而且很難找到原因。所以當一個研究者發(fā)現(xiàn)實驗結果出現(xiàn)意外,尤其是“意外”可能孕育著重大或重要發(fā)現(xiàn)時,就一定要在多個層次上考查其“可重復性”。

這方面的教訓是常見的。有一次,一個學生興沖沖地告訴我,發(fā)現(xiàn)用大腸桿菌表達的細菌的溶血素可以誘導細胞凋亡。這可是幾十年來沒見過的“大發(fā)現(xiàn)”。我問她用的什么做對照,她回答說是生理鹽水。我提醒她自己想想這樣對照行不行。學生很不錯,馬上回去用攜帶載體質粒的大腸桿菌提取“純化”蛋白做對照,結果同樣引起凋亡,說明是大腸桿菌表面脂多糖引起的細胞凋亡,與溶血素無關。

因此,所謂的重復實驗有兩層不同含義。一種是最基本的,就是重復做同樣的實驗。這屬于最低水平的重復,目的是糾正操作誤差。但是,現(xiàn)在實驗技術越來越先進,操作誤差比較好控制,最致命的是系統(tǒng)誤差。要避免這方面問題,最重要的是不斷總結經驗教訓,打好基礎。

我剛到美國讀研時,老師給我的第一個任務是測定一個中和抗體的滴度。我測了一周,發(fā)現(xiàn)誤差達到25%。雖然導師說可以,但我覺得不對勁,就申請了一周重復實驗,不管怎么重復誤差還是很大。最后一天,我真絕望了。但是,我意識到一定不是操作誤差,就到圖書館去查以前的論文,終于發(fā)現(xiàn)自己的數(shù)據根本不在線性范圍內;氐綄嶒炇遥徽{整實驗方法,問題就解決了。第二天拿給導師看,他非常高興。后來他跟我說,如果一開始就告訴我問題在哪里,我很快就會忘記,只有自己從失敗中總結出來的經驗,才一輩子都不會忘記。

我現(xiàn)在指導學生的時候,會單獨教一些比較特殊的測定。有的學生跟我說:“趙老師你教的跟教科書不一樣。”其實,教科書往往是從“傳授知識”的角度闡述前人總結的規(guī)律,而后來者只有經過自己的實踐,才能真正理解。

我現(xiàn)在70多歲了,在科學研究中,絕大部分時間依然是在“摸索”。比如我老師留下的一個重要研究課題,經過幾代研究生的努力、換了多種方法,雖然有進展,但依然沒有真正突破,我還在努力。

我們對客觀世界的認識相對來說總有片面性、局限性,所以需要不斷研究,在反復的實驗及證偽過程中提煉真知。這才是對待實驗的科學態(tài)度。

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